MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Shi470 chromosome

Total Repeats: 3861

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010698	GGT	2	6	4086	4091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010698	TAT	2	6	4134	4139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010698	TGG	2	6	4178	4183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010698	ATGC	2	8	4282	4289	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_010698	TGG	2	6	4298	4303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010698	GTG	2	6	4414	4419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010698	ACC	2	6	4446	4451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_010698	GGT	2	6	4459	4464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010698	A	7	7	4580	4586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010698	T	8	8	4600	4607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010698	AAT	2	6	4621	4626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010698	GAAAC	2	10	4653	4662	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_010698	TAAA	2	8	4693	4700	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010698	A	6	6	4698	4703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010698	ATT	2	6	4817	4822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010698	T	7	7	4835	4841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010698	A	6	6	4846	4851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010698	A	6	6	4862	4867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010698	TGT	2	6	4901	4906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010698	TTTTA	2	10	4923	4932	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010698	TC	3	6	4968	4973	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_010698	C	6	6	4995	5000	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
23	NC_010698	A	8	8	5001	5008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010698	A	6	6	5017	5022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010698	T	6	6	5220	5225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010698	CATT	2	8	5285	5292	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_010698	ATT	2	6	5307	5312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010698	A	6	6	5519	5524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010698	C	6	6	5539	5544	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
30	NC_010698	A	6	6	5561	5566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010698	CATT	2	8	5596	5603	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_010698	GTT	2	6	5609	5614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010698	TAA	2	6	5678	5683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010698	TTA	2	6	5736	5741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010698	GTG	2	6	5805	5810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010698	GTT	2	6	5825	5830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010698	GTGC	2	8	5865	5872	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_010698	TCT	2	6	5949	5954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010698	C	6	6	5971	5976	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
40	NC_010698	ATG	2	6	6025	6030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010698	AGT	2	6	6034	6039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010698	CTTGCG	2	12	6109	6120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010698	AGA	2	6	6155	6160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010698	AC	3	6	6296	6301	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_010698	CTT	2	6	6403	6408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010698	TAG	5	15	6430	6444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010698	TGT	2	6	6473	6478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010698	GTCGT	2	10	6501	6510	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_010698	TTG	2	6	6539	6544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010698	GTT	2	6	6608	6613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010698	TGGT	2	8	6656	6663	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010698	CCG	2	6	6742	6747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_010698	ATCG	2	8	6830	6837	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_010698	GCT	2	6	6857	6862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010698	CGTT	2	8	6865	6872	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_010698	A	6	6	7004	7009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010698	GA	5	10	7043	7052	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010698	T	7	7	7062	7068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010698	AAT	2	6	7115	7120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010698	TGT	2	6	7187	7192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010698	A	8	8	7196	7203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010698	T	7	7	7205	7211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010698	TAA	3	9	9007	9015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010698	ATAA	2	8	9398	9405	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010698	TAA	2	6	9488	9493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010698	ATT	2	6	9507	9512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010698	TTA	2	6	9533	9538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010698	T	6	6	9584	9589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010698	TATT	2	8	9597	9604	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010698	ATTC	2	8	9612	9619	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_010698	ACA	2	6	9629	9634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_010698	GAA	2	6	9647	9652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010698	GCTTT	2	10	13330	13339	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_010698	T	6	6	13337	13342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010698	T	7	7	13399	13405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010698	ATA	2	6	13409	13414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010698	TTAA	2	8	13428	13435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010698	AGTT	2	8	16374	16381	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010698	CA	3	6	16435	16440	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_010698	CTG	2	6	16456	16461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_010698	A	6	6	16591	16596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010698	AAACAC	2	12	18064	18075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_010698	TAT	2	6	20886	20891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010698	AATC	3	12	22478	22489	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_010698	TTAG	2	8	22679	22686	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010698	CTTT	2	8	22694	22701	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_010698	AAAAG	2	10	22739	22748	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010698	AAG	2	6	22757	22762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010698	CTT	2	6	24881	24886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_010698	GATT	2	8	24894	24901	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010698	ATTA	2	8	24990	24997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010698	A	13	13	25015	25027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010698	GTT	2	6	25089	25094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010698	A	6	6	25111	25116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010698	AG	3	6	25177	25182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010698	A	6	6	26705	26710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010698	T	6	6	26740	26745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010698	A	6	6	26783	26788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010698	TA	3	6	26802	26807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010698	T	6	6	28142	28147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010698	A	6	6	28174	28179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010698	TCA	2	6	29723	29728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_010698	T	6	6	29771	29776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010698	GGTT	2	8	29858	29865	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010698	A	6	6	38463	38468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010698	TAA	2	6	38488	38493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010698	A	6	6	38498	38503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010698	AG	3	6	38508	38513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010698	GATT	2	8	42264	42271	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010698	TAA	2	6	46582	46587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010698	TAA	2	6	46590	46595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010698	TCTTTG	2	12	48591	48602	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_010698	T	6	6	49622	49627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010698	TTTA	2	8	54927	54934	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010698	GCGG	2	8	54965	54972	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
116	NC_010698	T	6	6	54998	55003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010698	TAAT	2	8	55027	55034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010698	TTTA	2	8	55116	55123	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010698	TAA	3	9	55133	55141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010698	TTAAA	2	10	55196	55205	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010698	A	6	6	55215	55220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010698	ACAAA	2	10	55225	55234	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_010698	G	7	7	55477	55483	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010698	T	6	6	55774	55779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010698	AAAGA	2	10	55823	55832	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010698	AGA	2	6	55854	55859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010698	CAA	2	6	55863	55868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_010698	AGA	2	6	55875	55880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010698	GATC	2	8	55935	55942	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_010698	TTG	2	6	57423	57428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010698	GAT	2	6	57438	57443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010698	CGATC	2	10	57488	57497	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
133	NC_010698	CGC	2	6	57559	57564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_010698	AATGA	2	10	57570	57579	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010698	TTGC	2	8	57650	57657	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_010698	C	6	6	57674	57679	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
137	NC_010698	TA	3	6	57690	57695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010698	TTTA	2	8	57849	57856	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010698	AGA	2	6	57890	57895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010698	CAA	2	6	57936	57941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_010698	T	7	7	58012	58018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010698	TAT	2	6	58053	58058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010698	A	6	6	58063	58068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010698	TAA	2	6	58127	58132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010698	AGA	2	6	58139	58144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010698	T	6	6	58164	58169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010698	CTA	2	6	58261	58266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_010698	AAAG	2	8	58289	58296	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010698	AG	3	6	58326	58331	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_010698	GT	3	6	58404	58409	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_010698	AGCGGG	2	12	58455	58466	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
152	NC_010698	CTA	2	6	58508	58513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_010698	TTA	2	6	58539	58544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_010698	CGA	2	6	58585	58590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_010698	TGG	2	6	58609	58614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_010698	TGA	2	6	59506	59511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_010698	GAATG	2	10	102623	102632	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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294	NC_010698	A	7	7	102901	102907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_010698	ATG	2	6	102937	102942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
296	NC_010698	TAC	2	6	103050	103055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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298	NC_010698	CT	3	6	103209	103214	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
299	NC_010698	AGCA	2	8	103269	103276	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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445	NC_010698	ATT	2	6	169221	169226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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449	NC_010698	TTA	2	6	169472	169477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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452	NC_010698	CAAAA	2	10	169599	169608	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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454	NC_010698	TAT	2	6	172612	172617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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467	NC_010698	TCTT	2	8	178296	178303	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
468	NC_010698	TTG	2	6	178329	178334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
469	NC_010698	TAA	2	6	178349	178354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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472	NC_010698	AGA	2	6	178453	178458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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475	NC_010698	TA	3	6	178517	178522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
476	NC_010698	ATC	2	6	178539	178544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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486	NC_010698	TC	3	6	179056	179061	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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500	NC_010698	TGCA	2	8	179784	179791	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

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